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188金宝搏入口【产业研究】算力时代下加快推动白银市以生物信息为核心的泛基因科学产业发展

发布时间:2024-08-14 10:15 点击量:

  当前白银市处于工业经济向先进数字经济演进发展关键期,具备巨大市场发展潜力,应当抢占先机发展新兴先进超级计算技术产业。

  目前因生物信息领域发展较晚,国内外生物信息计算仍停留在高度依赖人工复杂操作流程的云计算方案,当前通用的超算操作系统主要为有限元分析、AI大模型训练设计,适用于单任务大算力,对于生物信息学计算等大队列计算匹配度极低,甘肃省科学院白银分院通过多年技术攻关,针对精准医学、分子育种、合成生物学、所开发的大队列生物超级计算系统达到国际领先水平,是目前国际上首个可商用的生物型超算系统,目前已进入中试后期,已成功开展商业计算,具备大规模使用能力。已为包括陇南市疾控中心、天津大学、白银市第一人民医院、西北农林科技大学、中国农业科学院昆明动物所、中国水产研究院黄海水产研究所等在科研或行业单位提供了包括基因组、转录组、宏基因组在内的多组学大队列计算服务,并可实现单样本最低60元的全基因组(lcWGS)分子育种。本系统生物计算领域综合性能远超国内外超算主流采用的Slurm、PBS等系统,约1.1万行核心代码100%由AI完成撰写,未使用1名人类计算机工程师。可实现十万台级数据与资源共识,半分钟内即可完成“万”样本级任务并发和数据管理,使用复杂度大幅降低,将生信分析操作工程师培训成本从100余课时降低至10min以内。对于科研机构及相关行业单位,综合算力成本可降低80-90%。

  随着2021年因美纳公司、完美基因公司(华大智造)等公司突破Tb级基因测序仪生产技术,基因信息测序仪呈现井喷式增长,生物相关研究队列从单个样本为主快速飙升至千级到百万级,市场规模达数百亿。但传统超算方案中单人仅可完成不超过30个任务并行,无法有效解决当前生物信息分析难题!

  图1 中国国家生物信息中心公开数据库数据汇交量统计表(截至2024年8月1日)

  目前,甘肃省科学院白银分院分子育种与生物超算中心DNAParse去中心化生物超算系统与lcWGS全基因组畜牧育种系统进入科技成果转化的关键阶段,技术系统已成熟具备产业化应用能力,中心还积极开展东西部协作、凝聚省内科研力量188金宝搏,吸引东部成熟的分子育种上游技术落户甘肃。

  1、希望给与农业、医学相关科研项目支持和产业倾斜,着重在我市率先推动以生物信息为核心的泛基因科学产业发展与相关技术成果研发。

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  2、希望能够加强与卫健、疾控、动检、海关、市场监管系统的联动,解决我市卫健医院系统科研短板,提升综合科研水平,提高我市医院的排名。

  3、完善科研基础条件188金宝搏在线入口,依托市卫健委等职能部门建设可面向域内普通科研机构的伦理审查委员会,解决科研相关的核心法律问题。

  4、推动我市和周边省市畜牧业育种企业技术升级,尽早实现全基因组分子育种技术落地覆盖,提供育种效率与经济效益。

  5、深化农医生工领域的津甘东西协作,借助以天津大学、天开园为主的天津市资源,开展技术应用、东数西算。

  6、希望电信、联通两大主要有线互联网运营商实现对孵化器的光纤覆盖,解决通讯难题。

  7、需要与我市光伏类发电企业实现合作联动,在光伏厂就地完成日间光伏电力消纳,降低算力耗电成本。

  8、计划后期将我市整体部署为一个大型的去中心化超级计算系统,承接国内10%以上的生物计算任务,在各个光伏发电场内多点部署超算系统,实现电力网、算力网100%契合,需要在我市内铺设大宽带城域网,并与兰州新区即将建成的国家互联网骨干节点对接,实现生命科学及其他大数据的顺利传输。

  【作者简介】李毅 产业经济学博士、经济学二级教授,甘肃省社会科学院和甘肃省科学院特聘二级研究员,白银分院院长;甘肃省腐蚀与防护学会理事长、甘肃省农村专业技术联合会副会长。

  原标题:《【产业研究】算力时代下加快推动白银市以生物信息为核心的泛基因科学产业发展》

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